Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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AP3B2Q13367 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AP3B2Q13367 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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