Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRAF3Q13114 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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TRAF3Q13114 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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TRAF3Q13114 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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TRAF3Q13114 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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TRAF3Q13114 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
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TRAF3Q13114 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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TRAF3Q13114 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TRAF3Q13114 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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