Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SCAPQ12770 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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