Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CACNB2Q08289 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CACNB2Q08289 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms