Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB1P82279 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB1P82279 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB1P82279 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB1P82279 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB1P82279 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB1P82279 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB1P82279 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB1P82279 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CRB1P82279 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CRB1P82279 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CRB1P82279 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CRB1P82279 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CRB1P82279 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms