Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVK11-1P61568 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ERVK11-1P61568 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms