Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ERVFRD-1P60508 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ERVFRD-1P60508 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms