Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KLF3P57682 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KLF3P57682 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KLF3P57682 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms