Protein–RNA interactions for Protein: P56381

ATP5E, ATP synthase subunit epsilon, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5EP56381 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 FAM212B-201ENST00000357260 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 CEMIP-202ENST00000356249 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
ATP5EP56381 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms