Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GEMP55040 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GEMP55040 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEMP55040 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEMP55040 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEMP55040 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEMP55040 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEMP55040 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEMP55040 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEMP55040 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEMP55040 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEMP55040 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEMP55040 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEMP55040 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GEMP55040 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GEMP55040 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
GEMP55040 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GEMP55040 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GEMP55040 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEMP55040 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEMP55040 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEMP55040 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEMP55040 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GEMP55040 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms