Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CCR4P51679 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CCR4P51679 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCR4P51679 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCR4P51679 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCR4P51679 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCR4P51679 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCR4P51679 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCR4P51679 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCR4P51679 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCR4P51679 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCR4P51679 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCR4P51679 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CCR4P51679 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CCR4P51679 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms