Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTBP49356 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTBP49356 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTBP49356 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTBP49356 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTBP49356 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FNTBP49356 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FNTBP49356 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FNTBP49356 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FNTBP49356 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTBP49356 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
FNTBP49356 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms