Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
SLC6A9P48067 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SLC6A9P48067 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms