Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MCAMP43121 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MCAMP43121 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCAMP43121 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCAMP43121 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCAMP43121 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCAMP43121 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCAMP43121 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCAMP43121 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCAMP43121 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCAMP43121 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MCAMP43121 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MCAMP43121 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCAMP43121 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCAMP43121 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCAMP43121 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MCAMP43121 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
MCAMP43121 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MCAMP43121 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms