Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
LIPAP38571 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
LIPAP38571 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPAP38571 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPAP38571 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPAP38571 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPAP38571 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPAP38571 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPAP38571 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPAP38571 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPAP38571 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPAP38571 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPAP38571 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPAP38571 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPAP38571 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPAP38571 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
LIPAP38571 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms