Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RPL9P32969 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RPL9P32969 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL9P32969 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms