Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CD40LGP29965 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms