Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
ABCD3P28288 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
ABCD3P28288 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms