Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGA6P23229 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGA6P23229 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms