Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CASTP20810 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CASTP20810 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASTP20810 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASTP20810 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASTP20810 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASTP20810 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASTP20810 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASTP20810 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASTP20810 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASTP20810 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASTP20810 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASTP20810 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASTP20810 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASTP20810 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CASTP20810 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CASTP20810 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CASTP20810 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms