Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
DESP17661 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
DESP17661 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
DESP17661 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
DESP17661 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms