Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXB4P17483 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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HOXB4P17483 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
HOXB4P17483 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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