Protein–RNA interactions for Protein: P13682

ZNF35, Zinc finger protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF35P13682 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
ZNF35P13682 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ZNF35P13682 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms