Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH1P12830 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH1P12830 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH1P12830 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH1P12830 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH1P12830 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH1P12830 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH1P12830 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH1P12830 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH1P12830 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH1P12830 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH1P12830 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH1P12830 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH1P12830 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH1P12830 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH1P12830 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDH1P12830 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CDH1P12830 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CDH1P12830 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CDH1P12830 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms