Protein–RNA interactions for Protein: P11487

FGF3, Fibroblast growth factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGF3P11487 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FGF3P11487 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FGF3P11487 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGF3P11487 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGF3P11487 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGF3P11487 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGF3P11487 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGF3P11487 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGF3P11487 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGF3P11487 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGF3P11487 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FGF3P11487 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FGF3P11487 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGF3P11487 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGF3P11487 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGF3P11487 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FGF3P11487 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGF3P11487 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGF3P11487 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGF3P11487 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGF3P11487 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGF3P11487 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGF3P11487 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FGF3P11487 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGF3P11487 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FGF3P11487 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms