Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LAMC1P11047 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LAMC1P11047 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms