Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HKR1P10072 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms