Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MSMBP08118 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MSMBP08118 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
MSMBP08118 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
MSMBP08118 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms