Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SMARCA5O60264 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMARCA5O60264 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms