Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UBXN8O00124 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms