Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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