Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TMEM200CA6NKL6 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms