Protein–RNA interactions for Protein: A0AVT1

UBA6, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA6A0AVT1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBA6A0AVT1 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms