Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PLXND1Q9Y4D7 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms