Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBM8

MGAT4C, Alpha-1,3-mannosyl-glycoprotein 4-beta-N-acetylglucosaminyltransferase C, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGAT4CQ9UBM8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
MGAT4CQ9UBM8 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms