Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
KCMF1Q9P0J7 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
KCMF1Q9P0J7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms