Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53CQ9NYF3 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
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FAM53CQ9NYF3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
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FAM53CQ9NYF3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
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FAM53CQ9NYF3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM53CQ9NYF3 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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FAM53CQ9NYF3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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FAM53CQ9NYF3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
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FAM53CQ9NYF3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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FAM53CQ9NYF3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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FAM53CQ9NYF3 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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FAM53CQ9NYF3 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM53CQ9NYF3 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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