Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VNN3Q9NY84 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VNN3Q9NY84 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms