Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ7

UFSP2, Ufm1-specific protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP2Q9NUQ7 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
UFSP2Q9NUQ7 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UFSP2Q9NUQ7 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms