Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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COMMD5Q9GZQ3 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
COMMD5Q9GZQ3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
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