Protein–RNA interactions for Protein: Q9BR84

ZNF559, Zinc finger protein 559, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF559Q9BR84 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ZNF559Q9BR84 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms