Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SPACA9Q96E40 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.5 ms