Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

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Length 353 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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TRIM63Q969Q1 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM63Q969Q1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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