Protein–RNA interactions for Protein: Q93099

HGD, Homogentisate 1,2-dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HGDQ93099 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HGDQ93099 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HGDQ93099 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HGDQ93099 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HGDQ93099 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HGDQ93099 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HGDQ93099 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HGDQ93099 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HGDQ93099 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HGDQ93099 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HGDQ93099 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HGDQ93099 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HGDQ93099 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms