Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NCSTNQ92542 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms