Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
APOBEC4Q8WW27 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms