Protein–RNA interactions for Protein: Q86YS3

RAB11FIP4, Rab11 family-interacting protein 4, humanhuman

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Length 637 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP4Q86YS3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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RAB11FIP4Q86YS3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RAB11FIP4Q86YS3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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RAB11FIP4Q86YS3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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RAB11FIP4Q86YS3 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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RAB11FIP4Q86YS3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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RAB11FIP4Q86YS3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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RAB11FIP4Q86YS3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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RAB11FIP4Q86YS3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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RAB11FIP4Q86YS3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
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RAB11FIP4Q86YS3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RAB11FIP4Q86YS3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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