Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP31Q70CQ4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
USP31Q70CQ4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
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