Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ATF7IPQ6VMQ6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ATF7IPQ6VMQ6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms