Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC9A4Q6AI14 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC9A4Q6AI14 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms